Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nphp4P59240 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp4P59240 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms