Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpm2P58774 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm2P58774 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm2P58774 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms