Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Dpf3P58269 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dpf3P58269 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dpf3P58269 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms