Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FusP56959 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FusP56959 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FusP56959 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FusP56959 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FusP56959 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FusP56959 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FusP56959 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FusP56959 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FusP56959 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FusP56959 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FusP56959 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FusP56959 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FusP56959 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FusP56959 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FusP56959 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FusP56959 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FusP56959 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FusP56959 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FusP56959 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FusP56959 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FusP56959 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FusP56959 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FusP56959 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FusP56959 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FusP56959 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FusP56959 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FusP56959 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FusP56959 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FusP56959 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FusP56959 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FusP56959 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FusP56959 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FusP56959 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FusP56959 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FusP56959 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FusP56959 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FusP56959 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FusP56959 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FusP56959 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FusP56959 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FusP56959 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FusP56959 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FusP56959 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FusP56959 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FusP56959 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FusP56959 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FusP56959 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FusP56959 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FusP56959 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FusP56959 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FusP56959 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FusP56959 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FusP56959 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FusP56959 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FusP56959 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FusP56959 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FusP56959 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FusP56959 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FusP56959 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FusP56959 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FusP56959 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FusP56959 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FusP56959 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FusP56959 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FusP56959 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FusP56959 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FusP56959 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FusP56959 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FusP56959 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 250.2 ms