Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bace1P56818 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bace1P56818 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace1P56818 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace1P56818 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bace1P56818 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bace1P56818 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Bace1P56818 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bace1P56818 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Bace1P56818 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bace1P56818 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bace1P56818 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms