Protein–RNA interactions for Protein: P56656

Cyp2c39, Cytochrome P450 2C39, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c39P56656 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2c39P56656 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp2c39P56656 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp2c39P56656 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp2c39P56656 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp2c39P56656 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp2c39P56656 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp2c39P56656 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp2c39P56656 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp2c39P56656 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp2c39P56656 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp2c39P56656 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp2c39P56656 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c39P56656 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c39P56656 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms