Protein–RNA interactions for Protein: P56655

Cyp2c38, Cytochrome P450 2C38, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c38P56655 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp2c38P56655 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c38P56655 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c38P56655 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms