Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd38P56528 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd38P56528 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd38P56528 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd38P56528 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd38P56528 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd38P56528 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd38P56528 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd38P56528 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd38P56528 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd38P56528 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.3 ms