Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gp1bbP56400 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gp1bbP56400 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp1bbP56400 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms