Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CdaP56389 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CdaP56389 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CdaP56389 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CdaP56389 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CdaP56389 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CdaP56389 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CdaP56389 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CdaP56389 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CdaP56389 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CdaP56389 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CdaP56389 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CdaP56389 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CdaP56389 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CdaP56389 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CdaP56389 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CdaP56389 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CdaP56389 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CdaP56389 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CdaP56389 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CdaP56389 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CdaP56389 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CdaP56389 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CdaP56389 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CdaP56389 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CdaP56389 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CdaP56389 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CdaP56389 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CdaP56389 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CdaP56389 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CdaP56389 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CdaP56389 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CdaP56389 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CdaP56389 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CdaP56389 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CdaP56389 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CdaP56389 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CdaP56389 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CdaP56389 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CdaP56389 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CdaP56389 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CdaP56389 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CdaP56389 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CdaP56389 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CdaP56389 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CdaP56389 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CdaP56389 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CdaP56389 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CdaP56389 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CdaP56389 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CdaP56389 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CdaP56389 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CdaP56389 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CdaP56389 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CdaP56389 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CdaP56389 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CdaP56389 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CdaP56389 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CdaP56389 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CdaP56389 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CdaP56389 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CdaP56389 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CdaP56389 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CdaP56389 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CdaP56389 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CdaP56389 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CdaP56389 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CdaP56389 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms