Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp1P56183 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms