Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acod1P54987 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acod1P54987 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acod1P54987 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acod1P54987 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acod1P54987 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms