Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PitpnbP53811 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PitpnbP53811 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PitpnbP53811 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PitpnbP53811 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PitpnbP53811 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PitpnbP53811 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PitpnbP53811 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PitpnbP53811 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PitpnbP53811 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PitpnbP53811 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PitpnbP53811 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PitpnbP53811 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PitpnbP53811 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PitpnbP53811 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PitpnbP53811 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms