Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fdft1P53798 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms