Protein–RNA interactions for Protein: P53776

Lhx4, LIM/homeobox protein Lhx4, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx4P53776 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx4P53776 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lhx4P53776 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms