Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna1P52793 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna1P52793 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efna1P52793 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efna1P52793 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna1P52793 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna1P52793 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna1P52793 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna1P52793 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna1P52793 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.8 ms