Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn3P51791 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn3P51791 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn3P51791 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms