Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RoraP51448 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RoraP51448 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RoraP51448 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RoraP51448 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RoraP51448 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RoraP51448 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RoraP51448 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RoraP51448 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RoraP51448 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RoraP51448 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RoraP51448 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RoraP51448 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RoraP51448 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RoraP51448 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RoraP51448 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RoraP51448 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RoraP51448 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RoraP51448 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RoraP51448 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RoraP51448 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RoraP51448 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RoraP51448 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RoraP51448 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RoraP51448 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RoraP51448 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RoraP51448 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RoraP51448 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RoraP51448 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RoraP51448 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RoraP51448 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RoraP51448 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RoraP51448 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RoraP51448 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RoraP51448 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RoraP51448 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RoraP51448 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RoraP51448 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RoraP51448 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RoraP51448 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RoraP51448 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RoraP51448 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RoraP51448 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RoraP51448 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RoraP51448 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RoraP51448 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RoraP51448 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RoraP51448 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RoraP51448 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RoraP51448 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RoraP51448 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RoraP51448 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RoraP51448 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RoraP51448 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RoraP51448 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RoraP51448 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RoraP51448 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RoraP51448 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RoraP51448 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RoraP51448 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RoraP51448 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RoraP51448 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RoraP51448 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RoraP51448 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RoraP51448 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RoraP51448 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RoraP51448 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RoraP51448 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RoraP51448 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms