Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa6P50704 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa6P50704 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa6P50704 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa6P50704 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa6P50704 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa6P50704 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa6P50704 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa6P50704 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Defa6P50704 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Defa6P50704 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Defa6P50704 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa6P50704 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa6P50704 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Defa6P50704 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa6P50704 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa6P50704 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa6P50704 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Defa6P50704 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Defa6P50704 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa6P50704 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa6P50704 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Defa6P50704 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa6P50704 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa6P50704 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa6P50704 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa6P50704 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa6P50704 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa6P50704 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa6P50704 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa6P50704 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa6P50704 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa6P50704 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa6P50704 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa6P50704 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa6P50704 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa6P50704 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa6P50704 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa6P50704 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa6P50704 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa6P50704 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa6P50704 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa6P50704 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa6P50704 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa6P50704 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa6P50704 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa6P50704 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms