Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdi1P50396 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gdi1P50396 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdi1P50396 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms