Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc13P50207 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc13P50207 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc13P50207 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms