Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rfx1P48377 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx1P48377 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx1P48377 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms