Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn3P48299 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn3P48299 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edn3P48299 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edn3P48299 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn3P48299 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Edn3P48299 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Edn3P48299 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn3P48299 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn3P48299 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn3P48299 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn3P48299 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Edn3P48299 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edn3P48299 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms