Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbx2P48031 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbx2P48031 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms