Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rplp1P47955 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rplp1P47955 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms