Protein–RNA interactions for Protein: P47937

Tacr3, Neuromedin-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr3P47937 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tacr3P47937 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr3P47937 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms