Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SrprbP47758 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SrprbP47758 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SrprbP47758 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SrprbP47758 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SrprbP47758 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SrprbP47758 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrprbP47758 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrprbP47758 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrprbP47758 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrprbP47758 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SrprbP47758 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms