Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf4P43488 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf4P43488 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf4P43488 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms