Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gdf6P43028 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gdf6P43028 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf6P43028 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf6P43028 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf6P43028 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf6P43028 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf6P43028 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf6P43028 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf6P43028 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf6P43028 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf6P43028 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf6P43028 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf6P43028 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf6P43028 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gdf6P43028 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gdf6P43028 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdf6P43028 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf6P43028 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf6P43028 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gdf6P43028 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf6P43028 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf6P43028 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf6P43028 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf6P43028 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gdf6P43028 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf6P43028 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms