Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LifrP42703 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LifrP42703 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LifrP42703 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LifrP42703 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LifrP42703 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LifrP42703 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LifrP42703 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LifrP42703 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LifrP42703 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LifrP42703 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LifrP42703 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LifrP42703 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LifrP42703 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LifrP42703 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LifrP42703 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LifrP42703 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LifrP42703 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LifrP42703 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LifrP42703 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LifrP42703 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LifrP42703 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LifrP42703 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LifrP42703 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LifrP42703 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LifrP42703 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LifrP42703 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LifrP42703 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LifrP42703 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LifrP42703 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LifrP42703 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LifrP42703 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LifrP42703 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LifrP42703 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LifrP42703 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LifrP42703 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LifrP42703 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LifrP42703 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LifrP42703 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LifrP42703 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LifrP42703 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LifrP42703 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LifrP42703 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LifrP42703 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LifrP42703 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LifrP42703 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LifrP42703 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LifrP42703 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LifrP42703 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LifrP42703 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LifrP42703 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LifrP42703 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LifrP42703 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LifrP42703 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LifrP42703 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LifrP42703 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LifrP42703 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LifrP42703 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LifrP42703 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LifrP42703 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LifrP42703 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LifrP42703 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LifrP42703 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LifrP42703 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LifrP42703 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LifrP42703 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LifrP42703 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LifrP42703 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LifrP42703 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LifrP42703 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LifrP42703 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LifrP42703 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LifrP42703 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LifrP42703 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LifrP42703 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LifrP42703 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LifrP42703 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LifrP42703 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LifrP42703 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LifrP42703 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LifrP42703 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LifrP42703 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LifrP42703 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LifrP42703 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LifrP42703 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LifrP42703 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms