Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nkx1-2P42580 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nkx1-2P42580 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx1-2P42580 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms