Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ThpoP40226 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ThpoP40226 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ThpoP40226 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ThpoP40226 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ThpoP40226 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ThpoP40226 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ThpoP40226 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ThpoP40226 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ThpoP40226 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms