Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik2P39087 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik2P39087 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik2P39087 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik2P39087 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik2P39087 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik2P39087 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik2P39087 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grik2P39087 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik2P39087 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms