Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Stfa3P35173 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stfa3P35173 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms