Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptk2P34152 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptk2P34152 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms