Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nedd1P33215 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nedd1P33215 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nedd1P33215 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms