Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd28P31041 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd28P31041 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd28P31041 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd28P31041 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd28P31041 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cd28P31041 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms