Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd1P30999 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnnd1P30999 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnd1P30999 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms