Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd9P28357 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms