Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja8P28236 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja8P28236 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja8P28236 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja8P28236 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja8P28236 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja8P28236 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja8P28236 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja8P28236 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja8P28236 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja8P28236 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja8P28236 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja8P28236 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja8P28236 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms