Protein–RNA interactions for Protein: P28063

Psmb8, Proteasome subunit beta type-8, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb8P28063 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb8P28063 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms