Protein–RNA interactions for Protein: P27808

Mgat1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat1P27808 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mgat1P27808 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mgat1P27808 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms