Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6aP27664 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pde6aP27664 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde6aP27664 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms