Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Twist1P26687 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Twist1P26687 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Twist1P26687 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Twist1P26687 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Twist1P26687 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist1P26687 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist1P26687 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms