Protein–RNA interactions for Protein: P26516

Psmd7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd7P26516 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psmd7P26516 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmd7P26516 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmd7P26516 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms