Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af2P26369 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af2P26369 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af2P26369 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af2P26369 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af2P26369 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af2P26369 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af2P26369 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af2P26369 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af2P26369 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
U2af2P26369 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af2P26369 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af2P26369 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af2P26369 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms