Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna1P26231 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnna1P26231 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna1P26231 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna1P26231 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms