Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NdnP25233 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NdnP25233 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NdnP25233 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NdnP25233 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NdnP25233 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NdnP25233 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NdnP25233 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NdnP25233 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NdnP25233 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NdnP25233 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NdnP25233 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NdnP25233 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NdnP25233 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NdnP25233 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NdnP25233 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NdnP25233 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NdnP25233 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NdnP25233 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NdnP25233 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NdnP25233 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NdnP25233 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NdnP25233 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NdnP25233 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NdnP25233 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NdnP25233 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NdnP25233 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NdnP25233 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NdnP25233 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NdnP25233 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NdnP25233 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NdnP25233 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NdnP25233 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NdnP25233 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NdnP25233 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NdnP25233 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NdnP25233 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NdnP25233 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NdnP25233 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NdnP25233 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NdnP25233 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NdnP25233 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms