Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd12P23812 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd12P23812 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd12P23812 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms