Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkchP23298 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkchP23298 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkchP23298 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkchP23298 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkchP23298 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkchP23298 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms